挥神盾局所属的秘密复仇者暗杀明面上是联合国官员的a.i.m.人员而遭到停职处理，玛丽亚·希尔和莎朗·卡特先后成为神盾局最高指挥官。随后因一系列世界级的安全危机，神盾局逐渐从最初以世界安全为己任的军事与情报机构转向以美国安全为中心，立场越发极端的同时也与希望平等援助世界的超级英雄们渐渐对立。
大事件“秘密帝国”前奏中，为预防九头蛇卷土重来的莎朗·卡特将最高指挥官的位置让给美国队长史蒂夫·罗杰斯并与其一同秘密设置了神盾计划协议，殊不知此时的美国队长早已秘密地被红骷髅用宇宙立方替换成了有着九头蛇记忆的邪恶版本。
在九头蛇队长的阴谋下，九头蛇成功占领了整个美国、将原神盾局的资源全数吸收。当秘密帝国被瓦解后，神盾局也因为失去领导核心及利用价值而解体，成员和资产被美国的多数情报组织接收。
“两位上午好！”一个西装笔挺的男人带着墨镜站在了两人的房间门口，后门还跟着不少人。
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大事件“秘密帝国”前奏中，为预防九头蛇卷土重来的莎朗·卡特将最高指挥官的位置让给美国队长史蒂夫·罗杰斯并与其一同秘密设置了神盾计划协议，殊不知此时的美国队长早已秘密地被红骷髅用宇宙立方替换成了有着九头蛇记忆的邪恶版本。
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